PsyMuKB

Visualization of regulatory element with DNMs in transcripts

Visualization of de novo variants in transcripts

Visualization of original de novo CNV set

There is no corresponding data published yet, we will update it when such data available.

Transcripts

Transcript ID	Transcript exon region	Coding exon region
ENST00000308128	[[28956739, 28956922], [28965098, 28965134], [28966650, 28966782], [28968329, 28968485], [28968836, 28968981], [28970618, 28970785], [28971040, 28971175], [28972117, 28972303], [28979234, 28979506], [28980843, 28980983], [28983378, 28983597], [28986039, 28986336], [28989414, 28989554], [28989707, 28989771], [28991193, 28991411], [28992790, 28993879]]	[[28956874, 28956922], [28965098, 28965134], [28966650, 28966782], [28968329, 28968485], [28968836, 28968981], [28970618, 28970785], [28971040, 28971175], [28972117, 28972303], [28979234, 28979506], [28980843, 28980983], [28983378, 28983597], [28986039, 28986336], [28989414, 28989554], [28989707, 28989771], [28991193, 28991411], [28992790, 28993558]]
ENST00000359747	[[28956845, 28956922], [28965098, 28965134], [28966650, 28966782], [28968329, 28968485], [28968836, 28968981], [28970618, 28970785], [28971040, 28971175], [28972117, 28972303], [28979234, 28979506], [28980843, 28980983], [28983378, 28983597], [28986039, 28986336], [28989414, 28989554], [28991072, 28991411], [28992790, 28994875]]	[[28956874, 28956922], [28965098, 28965134], [28966650, 28966782], [28968329, 28968485], [28968836, 28968981], [28970618, 28970785], [28971040, 28971175], [28972117, 28972303], [28979234, 28979506], [28980843, 28980983], [28983378, 28983597], [28986039, 28986336], [28989414, 28989554], [28991072, 28991411], [28992790, 28993558]]
NM_001134453	[[28956739, 28956922], [28965098, 28965134], [28966650, 28966782], [28968329, 28968485], [28968836, 28968981], [28970618, 28970785], [28971040, 28971175], [28972117, 28972303], [28979234, 28979506], [28980843, 28980983], [28983378, 28983597], [28986039, 28986336], [28989414, 28989554], [28991072, 28991411], [28992790, 28994872]]	[[28956874, 28956922], [28965098, 28965134], [28966650, 28966782], [28968329, 28968485], [28968836, 28968981], [28970618, 28970785], [28971040, 28971175], [28972117, 28972303], [28979234, 28979506], [28980843, 28980983], [28983378, 28983597], [28986039, 28986336], [28989414, 28989554], [28991072, 28991411], [28992790, 28993558]]
NM_177986	[[28956739, 28956922], [28965098, 28965134], [28966650, 28966782], [28968329, 28968485], [28968836, 28968981], [28970618, 28970785], [28971040, 28971175], [28972117, 28972303], [28979234, 28979506], [28980843, 28980983], [28983378, 28983597], [28986039, 28986336], [28989414, 28989554], [28989707, 28989771], [28991193, 28991411], [28992790, 28994872]]	[[28956874, 28956922], [28965098, 28965134], [28966650, 28966782], [28968329, 28968485], [28968836, 28968981], [28970618, 28970785], [28971040, 28971175], [28972117, 28972303], [28979234, 28979506], [28980843, 28980983], [28983378, 28983597], [28986039, 28986336], [28989414, 28989554], [28989707, 28989771], [28991193, 28991411], [28992790, 28993558]]

Enhancer

Chrom	Start	End	Genehancer ID	Score	Attributes
chr18	GH18I031363	31363346	31363368	0.34	[{'connected_gene': 'DSG1', 'score': 10.94}, {'connected_gene': 'DSG4', 'score': 0.39}, {'connected_gene': 'RNU6-167P', 'score': 0.37}, {'connected_gene': 'GC18M031346', 'score': 0.37}, {'connected_gene': 'DSG1-AS1', 'score': 0.21}]
chr18	GH18I031376	31376732	31376791	0.5	[{'connected_gene': 'DSG4', 'score': 550.77}, {'connected_gene': 'RNU6-167P', 'score': 0.29}, {'connected_gene': 'GC18M031346', 'score': 0.29}, {'connected_gene': 'DSG1-AS1', 'score': 0.23}]
chr18	GH18I031399	31399047	31402501	0.8	[{'connected_gene': 'RNU6-167P', 'score': 10.72}, {'connected_gene': 'DSG1', 'score': 10.67}, {'connected_gene': 'DSC2', 'score': 9.92}, {'connected_gene': 'DSG1-AS1', 'score': 9.08}, {'connected_gene': 'GC18P031391', 'score': 0.44}, {'connected_gene': 'DSG4', 'score': 0.34}, {'connected_gene': 'PIR43200', 'score': 0.34}]
chr18	GH18I031396	31396429	31398283	1.04	[{'connected_gene': 'GC18P031391', 'score': 0.44}, {'connected_gene': 'DSG4', 'score': 0.34}, {'connected_gene': 'PIR43200', 'score': 0.31}, {'connected_gene': 'DSG1-AS1', 'score': 0.31}]
chr18	GH18I031398	31398498	31398501	0.38	[{'connected_gene': 'GC18P031391', 'score': 0.44}, {'connected_gene': 'DSG4', 'score': 0.34}, {'connected_gene': 'PIR43200', 'score': 0.31}, {'connected_gene': 'DSG1-AS1', 'score': 0.31}]