PsyMuKB

Visualization of regulatory element with DNMs in transcripts

Visualization of de novo variants in transcripts

Visualization of original de novo CNV set

There is no corresponding data published yet, we will update it when such data available.

Transcripts

Transcript ID	Transcript exon region	Coding exon region
ENST00000225719	[[28705922, 28706744], [28712006, 28712254], [28747858, 28748001], [28748681, 28748851], [28749691, 28750041], [28750523, 28750715], [28754408, 28754576], [28758789, 28758899], [28765992, 28766095], [28769325, 28769468], [28770819, 28770989], [28772708, 28773038], [28776570, 28776766], [28778728, 28778864], [28782356, 28782488], [28783273, 28783369], [28783479, 28783544], [28788197, 28788329], [28788894, 28789080], [28789387, 28789487], [28791605, 28797007]]	[[28705998, 28706744], [28712006, 28712254], [28747858, 28748001], [28748681, 28748851], [28749691, 28750041], [28750523, 28750715], [28754408, 28754576], [28758789, 28758899], [28765992, 28766095], [28769325, 28769468], [28770819, 28770989], [28772708, 28773038], [28776570, 28776766], [28778728, 28778864], [28782356, 28782488], [28783273, 28783369], [28783479, 28783544], [28788197, 28788329], [28788894, 28789080], [28789387, 28789487], [28791605, 28791832]]
ENST00000583275	[[28706633, 28706744], [28712006, 28712310]]	None
ENST00000543464	[[28707253, 28707660], [28712006, 28712254], [28747858, 28748001], [28748681, 28748851], [28749691, 28750041], [28750523, 28750715], [28754408, 28754576], [28758789, 28758899], [28765992, 28766095], [28769325, 28769468], [28770819, 28770989], [28772708, 28773038], [28776570, 28776766], [28778728, 28778864], [28782356, 28782488], [28783273, 28783369], [28783479, 28783544], [28788197, 28788329], [28788894, 28789080], [28789387, 28789487], [28791605, 28792035]]	[[28707655, 28707660], [28712006, 28712254], [28747858, 28748001], [28748681, 28748851], [28749691, 28750041], [28750523, 28750715], [28754408, 28754576], [28758789, 28758899], [28765992, 28766095], [28769325, 28769468], [28770819, 28770989], [28772708, 28773038], [28776570, 28776766], [28778728, 28778864], [28782356, 28782488], [28783273, 28783369], [28783479, 28783544], [28788197, 28788329], [28788894, 28789080], [28789387, 28789487], [28791605, 28791832]]
ENST00000581826	[[28766002, 28766095], [28769325, 28769468], [28770819, 28771162]]	None
ENST00000584221	[[28770819, 28770989], [28772708, 28773038], [28774579, 28774582], [28793264, 28793441]]	[[28770819, 28770989], [28772708, 28773038], [28774579, 28774582], [28793264, 28793316]]
ENST00000588977	[[28772708, 28773038], [28778728, 28778755]]	None
ENST00000584050	[[28776690, 28776766], [28778774, 28778864], [28782356, 28782488], [28783273, 28783369]]	[[28776690, 28776766], [28778774, 28778819]]
ENST00000584051	[[28777253, 28777312], [28778728, 28778864], [28782356, 28782488], [28783273, 28783369], [28783479, 28783544], [28788197, 28788284]]	None
ENST00000579502	[[28778827, 28778864], [28782356, 28782488], [28783273, 28783342], [28789413, 28789487], [28791605, 28791965]]	[[28778827, 28778864], [28782356, 28782488], [28783273, 28783342], [28789413, 28789424]]
ENST00000580396	[[28781038, 28783369], [28783479, 28783881]]	None
NM_001304	[[28705941, 28706744], [28712006, 28712254], [28747858, 28748001], [28748681, 28748851], [28749691, 28750041], [28750523, 28750715], [28754408, 28754576], [28758789, 28758899], [28765992, 28766095], [28769325, 28769468], [28770819, 28770989], [28772708, 28773038], [28776570, 28776766], [28778728, 28778864], [28782356, 28782488], [28783273, 28783369], [28783479, 28783544], [28788197, 28788329], [28788894, 28789080], [28789387, 28789487], [28791605, 28796675]]	[[28705998, 28706744], [28712006, 28712254], [28747858, 28748001], [28748681, 28748851], [28749691, 28750041], [28750523, 28750715], [28754408, 28754576], [28758789, 28758899], [28765992, 28766095], [28769325, 28769468], [28770819, 28770989], [28772708, 28773038], [28776570, 28776766], [28778728, 28778864], [28782356, 28782488], [28783273, 28783369], [28783479, 28783544], [28788197, 28788329], [28788894, 28789080], [28789387, 28789487], [28791605, 28791832]]
NM_001199775	[[28707495, 28707660], [28712006, 28712254], [28747858, 28748001], [28748681, 28748851], [28749691, 28750041], [28750523, 28750715], [28754408, 28754576], [28758789, 28758899], [28765992, 28766095], [28769325, 28769468], [28770819, 28770989], [28772708, 28773038], [28776570, 28776766], [28778728, 28778864], [28782356, 28782488], [28783273, 28783369], [28783479, 28783544], [28788197, 28788329], [28788894, 28789080], [28789387, 28789487], [28791605, 28796675]]	[[28707655, 28707660], [28712006, 28712254], [28747858, 28748001], [28748681, 28748851], [28749691, 28750041], [28750523, 28750715], [28754408, 28754576], [28758789, 28758899], [28765992, 28766095], [28769325, 28769468], [28770819, 28770989], [28772708, 28773038], [28776570, 28776766], [28778728, 28778864], [28782356, 28782488], [28783273, 28783369], [28783479, 28783544], [28788197, 28788329], [28788894, 28789080], [28789387, 28789487], [28791605, 28791832]]

Promoter

Chrom	Start	End	Description
chr17	28705921	28706000	CAGE_peak_1_at_CPD_5end