Visualization of regulatory element with DNMs in transcripts


Visualization of de novo variants in transcripts


Visualization of original de novo CNV set
   There is no corresponding data published yet, we will update it when such data available.
Transcripts
Transcript ID Transcript exon region Coding exon region
ENST00000568224 [[28477973, 28478223], [28488784, 28488956], [28489057, 28489198], [28493425, 28493519], [28493647, 28493703], [28493797, 28493866], [28493946, 28493993], [28495326, 28495439], [28497667, 28497811], [28497898, 28497971], [28498776, 28498862], [28498982, 28499062], [28500610, 28500707], [28503034, 28503333]] [[28488836, 28488956], [28489057, 28489198], [28493425, 28493519], [28493647, 28493703], [28493797, 28493866], [28493946, 28493993], [28495326, 28495439], [28497667, 28497811], [28497898, 28497971], [28498776, 28498862], [28498982, 28499062], [28500610, 28500670]]
ENST00000535392 [[28477982, 28478223], [28488784, 28488956], [28489057, 28489198], [28493425, 28493519], [28493647, 28493703], [28493797, 28493866], [28493946, 28493993], [28495326, 28495439], [28497667, 28497811], [28497898, 28497971], [28498776, 28498862], [28498982, 28499062], [28500610, 28500707], [28503034, 28503333]] [[28488836, 28488956], [28489057, 28489198], [28493425, 28493519], [28493647, 28493703], [28493797, 28493866], [28493946, 28493993], [28495326, 28495439], [28497667, 28497811], [28497898, 28497971], [28498776, 28498862], [28498982, 28499062], [28500610, 28500670]]
ENST00000564091 [[28488599, 28488680], [28488784, 28488956], [28489057, 28489198], [28493425, 28493519], [28493647, 28493698]] [[28488836, 28488956], [28489057, 28489198], [28493425, 28493519], [28493647, 28493698]]
ENST00000359984 [[28488599, 28488956], [28489057, 28489198], [28493425, 28493519], [28493647, 28493703], [28493797, 28493866], [28493946, 28493993], [28495326, 28495439], [28497667, 28497811], [28497898, 28497971], [28498776, 28498862], [28498982, 28499062], [28499911, 28499983], [28500610, 28500707], [28502802, 28502881], [28503034, 28503403]] [[28488836, 28488956], [28489057, 28489198], [28493425, 28493519], [28493647, 28493703], [28493797, 28493866], [28493946, 28493993], [28495326, 28495439], [28497667, 28497811], [28497898, 28497971], [28498776, 28498862], [28498982, 28499062], [28499911, 28499983], [28500610, 28500707], [28502802, 28502881], [28503034, 28503080]]
ENST00000360019 [[28488599, 28488956], [28489057, 28489198], [28493425, 28493519], [28493647, 28493703], [28493797, 28493866], [28493946, 28493993], [28495326, 28495439], [28497667, 28497811], [28497898, 28497971], [28498776, 28498862], [28498982, 28499062], [28499911, 28499983], [28500610, 28500707], [28502802, 28502881], [28503034, 28503156], [28503340, 28503623]] [[28488836, 28488956], [28489057, 28489198], [28493425, 28493519], [28493647, 28493703], [28493797, 28493866], [28493946, 28493993], [28495326, 28495439], [28497667, 28497811], [28497898, 28497971], [28498776, 28498862], [28498982, 28499062], [28499911, 28499983], [28500610, 28500707], [28502802, 28502881], [28503034, 28503080]]
ENST00000569430 [[28488599, 28488956], [28489057, 28489198], [28493425, 28493519], [28493647, 28493703], [28493797, 28493866], [28493946, 28493993], [28495326, 28495439], [28497667, 28497811], [28497898, 28497971], [28498776, 28498862], [28498982, 28499062], [28499911, 28499983], [28500610, 28500707], [28502802, 28502881], [28503034, 28503536], [28504815, 28504985], [28506661, 28506855]] [[28488836, 28488956], [28489057, 28489198], [28493425, 28493519], [28493647, 28493703], [28493797, 28493866], [28493946, 28493993], [28495326, 28495439], [28497667, 28497811], [28497898, 28497971], [28498776, 28498862], [28498982, 28499062], [28499911, 28499983], [28500610, 28500707], [28502802, 28502881], [28503034, 28503080]]
ENST00000333496 [[28488600, 28488956], [28489057, 28489198], [28493425, 28493519], [28493647, 28493703], [28493797, 28493866], [28493946, 28493993], [28495326, 28495439], [28497667, 28497811], [28497898, 28497971], [28498776, 28498862], [28498982, 28499062], [28500610, 28500707], [28502802, 28502881], [28503034, 28503156], [28503340, 28503363]] [[28488836, 28488956], [28489057, 28489198], [28493425, 28493519], [28493647, 28493703], [28493797, 28493866], [28493946, 28493993], [28495326, 28495439], [28497667, 28497811], [28497898, 28497971], [28498776, 28498862], [28498982, 28499062], [28500610, 28500707], [28502802, 28502881], [28503034, 28503080]]
ENST00000354630 [[28488600, 28488956], [28489057, 28489198], [28493425, 28493519], [28493647, 28493703], [28493928, 28493993], [28495326, 28495439], [28497667, 28497811], [28497898, 28497971], [28498776, 28498862], [28498982, 28499062], [28499911, 28499983], [28500610, 28500707], [28502802, 28502881], [28503034, 28503156], [28503340, 28503381]] [[28488836, 28488956], [28489057, 28489198], [28493425, 28493519], [28493647, 28493703], [28493928, 28493993], [28495326, 28495439], [28497667, 28497811], [28497898, 28497971], [28498776, 28498862], [28498982, 28499062], [28499911, 28499983], [28500610, 28500707], [28502802, 28502881], [28503034, 28503080]]
ENST00000355477 [[28488600, 28488956], [28489057, 28489198], [28493425, 28493519], [28493647, 28493703], [28493797, 28493866], [28493946, 28493993], [28495326, 28495439], [28497898, 28497971], [28498776, 28498862], [28498982, 28499062], [28499911, 28499983], [28500610, 28500707], [28502802, 28502881], [28503034, 28503156], [28503340, 28503381]] [[28488836, 28488956], [28489057, 28489198], [28493425, 28493519], [28493647, 28493703], [28493797, 28493866], [28493946, 28493993], [28495326, 28495439], [28497898, 28497971], [28498776, 28498862], [28498982, 28499062], [28499911, 28499983], [28500610, 28500707], [28502802, 28502881], [28503034, 28503080]]
ENST00000563874 [[28488600, 28488956], [28489057, 28489198], [28493425, 28493519], [28493647, 28493993], [28495326, 28495439], [28497667, 28497811], [28497898, 28497971], [28498776, 28498862], [28498982, 28499062], [28499911, 28499983], [28500610, 28500707], [28502802, 28502881], [28503034, 28503156], [28503340, 28503536], [28504815, 28505897]] None
ENST00000357806 [[28488611, 28488956], [28489057, 28489198], [28493425, 28493519], [28493647, 28493703], [28493797, 28493866], [28493946, 28493993], [28495326, 28495439], [28498776, 28498862], [28499911, 28499983], [28500610, 28500707], [28502802, 28502881], [28503034, 28503304]] [[28488836, 28488956], [28489057, 28489198], [28493425, 28493519], [28493647, 28493703], [28493797, 28493866], [28493946, 28493993], [28495326, 28495439], [28498776, 28498862], [28499911, 28499983], [28500610, 28500707], [28502802, 28502881], [28503034, 28503080]]
ENST00000357857 [[28488649, 28488956], [28489057, 28489198], [28493425, 28493519], [28493647, 28493703], [28493797, 28493866], [28493946, 28493993], [28495326, 28495439], [28497667, 28497811], [28497898, 28497971], [28498776, 28498862], [28498982, 28499062], [28499911, 28499983], [28500610, 28500707], [28503034, 28503174]] [[28488836, 28488956], [28489057, 28489198], [28493425, 28493519], [28493647, 28493703], [28493797, 28493866], [28493946, 28493993], [28495326, 28495439], [28497667, 28497811], [28497898, 28497971], [28498776, 28498862], [28498982, 28499062], [28499911, 28499983], [28500610, 28500670]]
ENST00000567963 [[28488649, 28488956], [28493797, 28493866], [28493946, 28493993], [28495326, 28495439], [28497667, 28497811], [28497898, 28497971], [28498776, 28498862], [28498982, 28499062], [28499911, 28499983], [28500610, 28500707], [28502802, 28502881], [28503034, 28503156], [28503340, 28503376]] [[28488836, 28488956], [28493797, 28493866], [28493946, 28493993], [28495326, 28495439], [28497667, 28497811], [28497898, 28497971], [28498776, 28498862], [28498982, 28499062], [28499911, 28499983], [28500610, 28500707], [28502802, 28502881], [28503034, 28503080]]
ENST00000395653 [[28488681, 28488956], [28489057, 28489198], [28493425, 28493519], [28493647, 28493703], [28493797, 28493866], [28493946, 28493993], [28495326, 28495439], [28497667, 28497811], [28497898, 28497971], [28498776, 28498862], [28499911, 28499983], [28500610, 28500707], [28503034, 28503344]] [[28488836, 28488956], [28489057, 28489198], [28493425, 28493519], [28493647, 28493703], [28493797, 28493866], [28493946, 28493993], [28495326, 28495439], [28497667, 28497811], [28497898, 28497971], [28498776, 28498862], [28499911, 28499983], [28500610, 28500612]]
ENST00000565354 [[28488707, 28488956], [28489057, 28489198], [28493425, 28493519], [28493647, 28493866], [28493946, 28493993], [28495326, 28495335]] None
ENST00000568422 [[28488803, 28488956], [28489057, 28489198], [28493425, 28493519], [28493647, 28493703], [28493797, 28493866], [28493946, 28493993], [28495326, 28495439], [28497898, 28497971], [28498776, 28498862], [28498982, 28499062], [28499911, 28499983], [28500610, 28500707], [28503034, 28503177]] [[28495353, 28495439], [28497898, 28497971], [28498776, 28498862], [28498982, 28499062], [28499911, 28499983], [28500610, 28500612]]
ENST00000568076 [[28488836, 28488956], [28489057, 28489198], [28493425, 28493703], [28493797, 28493866], [28493946, 28493993], [28495326, 28495439], [28498776, 28498862], [28498982, 28499062], [28499911, 28499983], [28500610, 28500707], [28502802, 28502881], [28503034, 28503080]] None
ENST00000561689 [[28488836, 28488956], [28489057, 28489198], [28493425, 28493703], [28493797, 28493866], [28493946, 28493993], [28495326, 28495439], [28497667, 28497811], [28497898, 28497971], [28498776, 28498862], [28499911, 28499983], [28500610, 28500707], [28503034, 28503080]] None
ENST00000565140 [[28488836, 28488956], [28489057, 28489198], [28490782, 28490907], [28493425, 28493519], [28493647, 28493703], [28493797, 28493866], [28493946, 28493993], [28495326, 28495439], [28498776, 28498862], [28498982, 28499062], [28499911, 28499983], [28500610, 28500707], [28502802, 28502881], [28503034, 28503080]] [[28495353, 28495439], [28498776, 28498862], [28498982, 28499062], [28499911, 28499983], [28500610, 28500707], [28502802, 28502881], [28503034, 28503080]]
ENST00000566057 [[28488836, 28488956], [28489057, 28489198], [28493425, 28493519], [28493647, 28493703], [28493797, 28493866], [28493946, 28493993], [28495326, 28495439], [28498776, 28498862], [28498982, 28499062], [28502802, 28502881], [28503034, 28503080]] [[28495412, 28495439], [28498776, 28498862], [28498982, 28499062], [28502802, 28502881], [28503034, 28503080]]
ENST00000568452 [[28488836, 28488956], [28489057, 28489198], [28493425, 28493703], [28493797, 28493866], [28493946, 28493993], [28495326, 28495439], [28497667, 28497811], [28497898, 28497971], [28498776, 28498862], [28498982, 28499062], [28499911, 28499983], [28500610, 28500707], [28502802, 28502881], [28503034, 28503080]] None
ENST00000565316 [[28488836, 28488956], [28489057, 28489198], [28493425, 28493519], [28493647, 28493703], [28493928, 28493993], [28495326, 28495439], [28497667, 28497811], [28497898, 28497971], [28498776, 28498862], [28498982, 28499062], [28499911, 28499983], [28500610, 28500707], [28502802, 28502881], [28503034, 28503080]] [[28488836, 28488956], [28489057, 28489198], [28493425, 28493519], [28493647, 28493703], [28493928, 28493993], [28495326, 28495439], [28497667, 28497811], [28497898, 28497971], [28498776, 28498862], [28498982, 28499062], [28499911, 28499983], [28500610, 28500707], [28502802, 28502881], [28503034, 28503080]]
ENST00000569030 [[28488836, 28488956], [28489057, 28489198], [28490964, 28491086], [28493425, 28493519], [28493647, 28493703], [28493797, 28493866], [28493946, 28493993], [28498776, 28498862], [28498982, 28499062], [28499911, 28499983], [28500610, 28500707], [28502802, 28502881], [28503034, 28503080]] [[28491050, 28491086], [28493425, 28493519], [28493647, 28493703], [28493797, 28493866], [28493946, 28493993], [28498776, 28498862], [28498982, 28499062], [28499911, 28499983], [28500610, 28500707], [28502802, 28502881], [28503034, 28503080]]
ENST00000357076 [[28491050, 28491086], [28493425, 28493519], [28493647, 28493703], [28493797, 28493866], [28493946, 28493993], [28498776, 28498862], [28498982, 28499062], [28499911, 28499983], [28500610, 28500707], [28502802, 28502881], [28503034, 28503156], [28503340, 28503381]] [[28491050, 28491086], [28493425, 28493519], [28493647, 28493703], [28493797, 28493866], [28493946, 28493993], [28498776, 28498862], [28498982, 28499062], [28499911, 28499983], [28500610, 28500707], [28502802, 28502881], [28503034, 28503080]]
ENST00000568558 [[28493470, 28493519], [28493647, 28493703], [28493797, 28493866], [28493946, 28493993], [28495326, 28495439], [28498776, 28498862], [28499911, 28499983], [28500610, 28500707], [28503034, 28503180]] [[28493470, 28493519], [28493647, 28493703], [28493797, 28493866], [28493946, 28493993], [28495326, 28495439], [28498776, 28498862], [28499911, 28499983], [28500610, 28500670]]
ENST00000568472 [[28493484, 28493519], [28493647, 28493703], [28493797, 28493866], [28493946, 28493993], [28495326, 28495439], [28500610, 28500707], [28503034, 28503094]] None
ENST00000564574 [[28493498, 28493703], [28493797, 28493866], [28493946, 28493993], [28495326, 28495439], [28497667, 28497811], [28497898, 28497971], [28498776, 28498862], [28498982, 28499062], [28499911, 28499983], [28500610, 28500707], [28503034, 28503156], [28503340, 28503391]] None
ENST00000568497 [[28493676, 28493703], [28493797, 28493866], [28493946, 28493993], [28495326, 28495439], [28500610, 28500707], [28502802, 28502881], [28503034, 28503179]] [[28495412, 28495439], [28500610, 28500707], [28502802, 28502881], [28503034, 28503080]]
ENST00000567495 [[28493797, 28493866], [28493946, 28493993], [28495326, 28495439], [28498776, 28498862], [28498982, 28499062], [28499911, 28499983], [28500610, 28500707], [28502802, 28502881], [28503034, 28503153]] [[28495353, 28495439], [28498776, 28498862], [28498982, 28499062], [28499911, 28499983], [28500610, 28500707], [28502802, 28502881], [28503034, 28503080]]
ENST00000566824 [[28493823, 28493993], [28495326, 28495439], [28497667, 28497811], [28497898, 28497971], [28498776, 28498862], [28499911, 28499983], [28500610, 28500707], [28502802, 28502881], [28503034, 28503156], [28503340, 28503393]] None
ENST00000566083 [[28493832, 28493993], [28495326, 28495439], [28497667, 28497811], [28497898, 28497971], [28498776, 28498862], [28498982, 28499062], [28499911, 28499983], [28500610, 28500707], [28502802, 28503158]] None
ENST00000565778 [[28493833, 28493866], [28493946, 28493993], [28495326, 28495439], [28498776, 28498862], [28500610, 28500707], [28502802, 28502881], [28503034, 28503148]] [[28493833, 28493866], [28493946, 28493993], [28495326, 28495439], [28498776, 28498862], [28500610, 28500707], [28502802, 28502881], [28503034, 28503080]]
ENST00000565047 [[28493836, 28493866], [28493946, 28493993], [28495326, 28495439], [28498776, 28498862], [28499911, 28499983], [28503034, 28503147]] None
ENST00000565688 [[28495337, 28495439], [28497667, 28497811], [28497898, 28497971], [28498776, 28498862], [28502802, 28502881], [28503034, 28503156], [28503340, 28503384]] [[28495337, 28495439], [28497667, 28497811], [28497898, 28497971], [28498776, 28498862], [28502802, 28502881], [28503034, 28503080]]
ENST00000561505 [[28497682, 28497811], [28497898, 28497971], [28498776, 28498862], [28499911, 28499983], [28500610, 28500707], [28503034, 28503156], [28503340, 28503370]] [[28497682, 28497811], [28497898, 28497971], [28498776, 28498862], [28499911, 28499983], [28500610, 28500612]]
ENST00000568443 [[28498982, 28499062], [28499911, 28499983], [28500610, 28500707], [28502802, 28503156], [28503340, 28503623]] [[28498982, 28499062], [28499911, 28499983], [28500610, 28500707], [28502802, 28503080]]
ENST00000567804 [[28500610, 28500707], [28502802, 28502881], [28503034, 28503156], [28503340, 28503536], [28504031, 28504094]] [[28500610, 28500707], [28502802, 28502881], [28503034, 28503080]]
ENST00000565236 [[28500634, 28500707], [28502282, 28502383], [28502802, 28502881], [28503034, 28503363]] None
ENST00000566040 [[28503425, 28503536], [28504815, 28505013], [28506661, 28506896]] None
ENST00000566472 [[28503457, 28503516], [28504815, 28505307]] None
ENST00000567160 [[28503510, 28503536], [28504815, 28504985], [28506446, 28506866]] None
ENST00000566816 [[28504874, 28505013], [28506446, 28506877]] None
NM_001286109 [[28477973, 28478223], [28488784, 28488956], [28489057, 28489198], [28493425, 28493519], [28493647, 28493703], [28493797, 28493866], [28493946, 28493993], [28495326, 28495439], [28497667, 28497811], [28497898, 28497971], [28498776, 28498862], [28498982, 28499062], [28500610, 28500707], [28503034, 28503403]] [[28488836, 28488956], [28489057, 28489198], [28493425, 28493519], [28493647, 28493703], [28493797, 28493866], [28493946, 28493993], [28495326, 28495439], [28497667, 28497811], [28497898, 28497971], [28498776, 28498862], [28498982, 28499062], [28500610, 28500670]]
NM_000086 [[28488599, 28488956], [28489057, 28489198], [28493425, 28493519], [28493647, 28493703], [28493797, 28493866], [28493946, 28493993], [28495326, 28495439], [28497667, 28497811], [28497898, 28497971], [28498776, 28498862], [28498982, 28499062], [28499911, 28499983], [28500610, 28500707], [28502802, 28502881], [28503034, 28503403]] [[28488836, 28488956], [28489057, 28489198], [28493425, 28493519], [28493647, 28493703], [28493797, 28493866], [28493946, 28493993], [28495326, 28495439], [28497667, 28497811], [28497898, 28497971], [28498776, 28498862], [28498982, 28499062], [28499911, 28499983], [28500610, 28500707], [28502802, 28502881], [28503034, 28503080]]
NM_001042432 [[28488599, 28488956], [28489057, 28489198], [28493425, 28493519], [28493647, 28493703], [28493797, 28493866], [28493946, 28493993], [28495326, 28495439], [28497667, 28497811], [28497898, 28497971], [28498776, 28498862], [28498982, 28499062], [28499911, 28499983], [28500610, 28500707], [28502802, 28502881], [28503034, 28503156], [28503340, 28503623]] [[28488836, 28488956], [28489057, 28489198], [28493425, 28493519], [28493647, 28493703], [28493797, 28493866], [28493946, 28493993], [28495326, 28495439], [28497667, 28497811], [28497898, 28497971], [28498776, 28498862], [28498982, 28499062], [28499911, 28499983], [28500610, 28500707], [28502802, 28502881], [28503034, 28503080]]
NM_001286110 [[28488600, 28488956], [28489057, 28489198], [28493425, 28493519], [28493647, 28493703], [28493797, 28493866], [28493946, 28493993], [28495326, 28495439], [28497667, 28497811], [28497898, 28497971], [28498776, 28498862], [28498982, 28499062], [28499911, 28499983], [28500610, 28500707], [28503034, 28503403]] [[28488836, 28488956], [28489057, 28489198], [28493425, 28493519], [28493647, 28493703], [28493797, 28493866], [28493946, 28493993], [28495326, 28495439], [28497667, 28497811], [28497898, 28497971], [28498776, 28498862], [28498982, 28499062], [28499911, 28499983], [28500610, 28500670]]
NM_001286105 [[28488600, 28488956], [28489057, 28489198], [28493425, 28493519], [28493647, 28493703], [28493797, 28493866], [28493946, 28493993], [28495326, 28495439], [28497667, 28497811], [28497898, 28497971], [28498776, 28498862], [28499911, 28499983], [28500610, 28500707], [28503034, 28503403]] [[28488836, 28488956], [28489057, 28489198], [28493425, 28493519], [28493647, 28493703], [28493797, 28493866], [28493946, 28493993], [28495326, 28495439], [28497667, 28497811], [28497898, 28497971], [28498776, 28498862], [28499911, 28499983], [28500610, 28500612]]
NM_001286104 [[28488600, 28488956], [28489057, 28489198], [28493425, 28493519], [28493647, 28493703], [28493797, 28493866], [28493946, 28493993], [28495326, 28495439], [28497667, 28497811], [28497898, 28497971], [28498776, 28498862], [28498982, 28499062], [28500610, 28500707], [28502802, 28502881], [28503034, 28503156], [28503340, 28503623]] [[28488836, 28488956], [28489057, 28489198], [28493425, 28493519], [28493647, 28493703], [28493797, 28493866], [28493946, 28493993], [28495326, 28495439], [28497667, 28497811], [28497898, 28497971], [28498776, 28498862], [28498982, 28499062], [28500610, 28500707], [28502802, 28502881], [28503034, 28503080]]
Promoter
Chrom Start End Description
chr16 28503255 28503301 CAGE_peak_3_at_CLN3_5end
chr16 28503312 28503321 CAGE_peak_8_at_CLN3_5end
chr16 28503327 28503356 CAGE_peak_2_at_CLN3_5end
chr16 28503357 28503409 CAGE_peak_1_at_CLN3_5end
Enhancer
Chrom Start End Genehancer ID Score Attributes
chr16 GH16I028945 28945201 28946289 1.51 [{'connected_gene': 'NFATC2IP', 'score': 37.11}, {'connected_gene': 'ENSG00000198106', 'score': 36.31}, {'connected_gene': 'ENSG00000260853', 'score': 36.26}, {'connected_gene': 'SPNS1', 'score': 34.0}, {'connected_gene': 'ENSG00000260367', 'score': 33.78}, {'connected_gene': 'SMG1P2', 'score': 30.22}, {'connected_gene': 'ATXN2L', 'score': 29.16}, {'connected_gene': 'NPIPB12', 'score': 24.85}, {'connected_gene': 'CLN3', 'score': 20.27}, {'connected_gene': 'SGF29', 'score': 18.95}, {'connected_gene': 'ENSG00000261766', 'score': 13.07}, {'connected_gene': 'SH2B1', 'score': 11.52}, {'connected_gene': 'ENSG00000251417', 'score': 11.33}, {'connected_gene': 'RRN3P2', 'score': 10.78}, {'connected_gene': 'CDIPT', 'score': 9.9}, {'connected_gene': 'CDC37P1', 'score': 7.18}, {'connected_gene': 'RABEP2', 'score': 0.44}]
chr16 GH16I028950 28950121 28952518 2.03 [{'connected_gene': 'NFATC2IP', 'score': 588.38}, {'connected_gene': 'SGF29', 'score': 36.07}, {'connected_gene': 'ATXN2L', 'score': 26.78}, {'connected_gene': 'ENSG00000260853', 'score': 25.74}, {'connected_gene': 'SMG1P2', 'score': 24.57}, {'connected_gene': 'SPNS1', 'score': 20.45}, {'connected_gene': 'ENSG00000260367', 'score': 18.21}, {'connected_gene': 'EIF3C', 'score': 14.91}, {'connected_gene': 'SULT1A2', 'score': 14.84}, {'connected_gene': 'NPIPB8', 'score': 13.25}, {'connected_gene': 'NPIPB10P', 'score': 12.59}, {'connected_gene': 'CLN3', 'score': 10.71}, {'connected_gene': 'EIF3CL', 'score': 10.33}, {'connected_gene': 'MVP', 'score': 10.18}, {'connected_gene': 'ENSG00000238045', 'score': 9.78}, {'connected_gene': 'KCTD13', 'score': 4.89}, {'connected_gene': 'TMEM219', 'score': 4.67}, {'connected_gene': 'MIR4517', 'score': 0.44}]
chr16 GH16I029007 29007585 29010790 1.39 [{'connected_gene': 'SPNS1', 'score': 16.27}, {'connected_gene': 'ENSG00000260853', 'score': 15.39}, {'connected_gene': 'NFATC2IP', 'score': 14.95}, {'connected_gene': 'SMG1P2', 'score': 14.91}, {'connected_gene': 'INO80E', 'score': 14.13}, {'connected_gene': 'ENSG00000260367', 'score': 11.86}, {'connected_gene': 'RRN3P2', 'score': 10.72}, {'connected_gene': 'TUFM', 'score': 10.71}, {'connected_gene': 'ENSG00000198106', 'score': 10.18}, {'connected_gene': 'SGF29', 'score': 9.76}, {'connected_gene': 'CDC37P1', 'score': 6.17}, {'connected_gene': 'CLN3', 'score': 4.63}, {'connected_gene': 'GC16M028992', 'score': 0.44}, {'connected_gene': 'NPIPB10P', 'score': 0.31}]
chr16 GH16I028936 28936020 28937154 1.61 [{'connected_gene': 'RABEP2', 'score': 550.77}, {'connected_gene': 'ENSG00000260853', 'score': 32.95}, {'connected_gene': 'SPNS1', 'score': 32.22}, {'connected_gene': 'NFATC2IP', 'score': 30.54}, {'connected_gene': 'ATXN2L', 'score': 28.53}, {'connected_gene': 'SMG1P2', 'score': 28.09}, {'connected_gene': 'ENSG00000260367', 'score': 27.89}, {'connected_gene': 'NPIPB12', 'score': 24.35}, {'connected_gene': 'ENSG00000198106', 'score': 23.5}, {'connected_gene': 'SGF29', 'score': 20.16}, {'connected_gene': 'CLN3', 'score': 11.21}, {'connected_gene': 'RRN3P2', 'score': 10.77}, {'connected_gene': 'NPIPB10P', 'score': 10.42}, {'connected_gene': 'ENSG00000238045', 'score': 9.83}, {'connected_gene': 'CD19', 'score': 0.77}]
chr16 GH16I028477 28477627 28478043 0.2 [{'connected_gene': 'TUFM', 'score': 37.45}, {'connected_gene': 'NPIPB7', 'score': 0.44}, {'connected_gene': 'ENSG00000261832', 'score': 0.39}, {'connected_gene': 'CLN3', 'score': 0.37}]
chr16 GH16I028542 28542601 28544525 1.02 [{'connected_gene': 'SULT1A2', 'score': 60.18}, {'connected_gene': 'TUFM', 'score': 28.42}, {'connected_gene': 'NPIPB7', 'score': 12.19}, {'connected_gene': 'CLN3', 'score': 11.9}, {'connected_gene': 'APOBR', 'score': 11.9}, {'connected_gene': 'CD19', 'score': 10.36}, {'connected_gene': 'RABEP2', 'score': 10.36}, {'connected_gene': 'IL27', 'score': 6.11}, {'connected_gene': 'ENSG00000251417', 'score': 4.3}, {'connected_gene': 'SULT1A1', 'score': 1.93}, {'connected_gene': 'NUPR1', 'score': 0.77}, {'connected_gene': 'ENSG00000271495', 'score': 0.44}]
chr16 GH16I028478 28478455 28479427 0.2 [{'connected_gene': 'SULT1A2', 'score': 55.96}, {'connected_gene': 'NPIPB7', 'score': 0.44}, {'connected_gene': 'ENSG00000261832', 'score': 0.39}, {'connected_gene': 'CLN3', 'score': 0.37}]
chr16 GH16I028480 28480406 28481408 0.66 [{'connected_gene': 'SULT1A2', 'score': 56.79}, {'connected_gene': 'NPIPB7', 'score': 0.44}, {'connected_gene': 'ENSG00000261832', 'score': 0.39}, {'connected_gene': 'CLN3', 'score': 0.39}]
chr16 GH16I028572 28572235 28573674 0.51 [{'connected_gene': 'SULT1A2', 'score': 41.83}, {'connected_gene': 'CLN3', 'score': 11.32}, {'connected_gene': 'APOBR', 'score': 11.32}, {'connected_gene': 'NPIPB7', 'score': 11.08}, {'connected_gene': 'GC16M028560', 'score': 0.77}, {'connected_gene': 'SGF29', 'score': 0.37}, {'connected_gene': 'GC16P028596', 'score': 0.34}]
chr16 GH16I028490 28490586 28497469 2.29 [{'connected_gene': 'APOBR', 'score': 555.53}, {'connected_gene': 'ENSG00000261832', 'score': 550.77}, {'connected_gene': 'CLN3', 'score': 550.77}, {'connected_gene': 'SULT1A2', 'score': 59.23}, {'connected_gene': 'ENSG00000261766', 'score': 20.85}, {'connected_gene': 'ENSG00000251417', 'score': 19.55}, {'connected_gene': 'SH2B1', 'score': 13.8}, {'connected_gene': 'ENSG00000260853', 'score': 13.74}, {'connected_gene': 'SPNS1', 'score': 12.63}, {'connected_gene': 'ATXN2L', 'score': 12.06}, {'connected_gene': 'NFATC2IP', 'score': 11.75}, {'connected_gene': 'ENSG00000198106', 'score': 11.18}, {'connected_gene': 'ENSG00000260367', 'score': 11.07}, {'connected_gene': 'CDC37P1', 'score': 8.17}, {'connected_gene': 'TUFM', 'score': 5.26}, {'connected_gene': 'PIR42003', 'score': 0.77}, {'connected_gene': 'PIR49782', 'score': 0.77}, {'connected_gene': 'GC16P028499', 'score': 0.77}, {'connected_gene': 'GC16P028497', 'score': 0.77}]
chr16 GH16I028525 28525496 28529342 0.94 [{'connected_gene': 'IL27', 'score': 550.77}, {'connected_gene': 'SULT1A2', 'score': 60.14}, {'connected_gene': 'TUFM', 'score': 35.42}, {'connected_gene': 'CLN3', 'score': 18.13}, {'connected_gene': 'APOBR', 'score': 12.87}, {'connected_gene': 'NPIPB7', 'score': 12.14}, {'connected_gene': 'SGF29', 'score': 12.08}, {'connected_gene': 'ENSG00000251417', 'score': 6.01}, {'connected_gene': 'PIR42560', 'score': 0.44}]
chr16 GH16I028524 28524413 28525226 0.68 [{'connected_gene': 'IL27', 'score': 550.77}, {'connected_gene': 'SULT1A2', 'score': 60.1}, {'connected_gene': 'CLN3', 'score': 12.75}, {'connected_gene': 'APOBR', 'score': 12.73}, {'connected_gene': 'ENSG00000251417', 'score': 5.97}, {'connected_gene': 'GC16P028499', 'score': 0.31}, {'connected_gene': 'PIR49782', 'score': 0.31}]
chr16 GH16I028821 28821934 28826329 2.33 [{'connected_gene': 'ATXN2L', 'score': 562.86}, {'connected_gene': 'ENSG00000275807', 'score': 550.77}, {'connected_gene': 'TUFM', 'score': 79.39}, {'connected_gene': 'NPIPB12', 'score': 29.75}, {'connected_gene': 'ENSG00000261766', 'score': 24.73}, {'connected_gene': 'SH2B1', 'score': 23.51}, {'connected_gene': 'ENSG00000198106', 'score': 20.36}, {'connected_gene': 'ENSG00000260853', 'score': 19.07}, {'connected_gene': 'ENSG00000251417', 'score': 14.46}, {'connected_gene': 'SPNS1', 'score': 13.44}, {'connected_gene': 'SMG1P2', 'score': 12.88}, {'connected_gene': 'CDC37P1', 'score': 11.36}, {'connected_gene': 'CLN3', 'score': 10.9}, {'connected_gene': 'NFATC2IP', 'score': 9.91}, {'connected_gene': 'NPIPB11', 'score': 9.79}, {'connected_gene': 'ENSG00000260796', 'score': 0.77}, {'connected_gene': 'ENSG00000260570', 'score': 0.39}, {'connected_gene': 'GC16M028787', 'score': 0.21}]
chr16 GH16I029271 29271006 29273490 1.6 [{'connected_gene': 'ENSG00000277999', 'score': 550.77}, {'connected_gene': 'NFATC2IP', 'score': 37.79}, {'connected_gene': 'SPNS1', 'score': 32.16}, {'connected_gene': 'ENSG00000260853', 'score': 27.72}, {'connected_gene': 'INO80E', 'score': 27.18}, {'connected_gene': 'ATXN2L', 'score': 26.62}, {'connected_gene': 'SMG1P2', 'score': 26.52}, {'connected_gene': 'ENSG00000260367', 'score': 21.33}, {'connected_gene': 'SGF29', 'score': 21.11}, {'connected_gene': 'PPP4C', 'score': 20.63}, {'connected_gene': 'ENSG00000260953', 'score': 16.89}, {'connected_gene': 'ENSG00000198106', 'score': 13.29}, {'connected_gene': 'CLN3', 'score': 12.49}, {'connected_gene': 'MVP', 'score': 12.26}, {'connected_gene': 'NPIPB12', 'score': 12.08}, {'connected_gene': 'SLX1A', 'score': 10.58}, {'connected_gene': 'NPIPB10P', 'score': 10.34}, {'connected_gene': 'ENSG00000238045', 'score': 9.84}, {'connected_gene': 'GDPD3', 'score': 9.84}, {'connected_gene': 'EIF3CL', 'score': 5.11}, {'connected_gene': 'ENSG00000284685', 'score': 0.12}]
chr16 GH16I028277 28277200 28278709 1.16 [{'connected_gene': 'ENSG00000260853', 'score': 17.67}, {'connected_gene': 'SPNS1', 'score': 16.6}, {'connected_gene': 'ENSG00000260367', 'score': 15.41}, {'connected_gene': 'NFATC2IP', 'score': 13.55}, {'connected_gene': 'CLN3', 'score': 12.78}, {'connected_gene': 'RRN3P2', 'score': 11.38}, {'connected_gene': 'ATXN2L', 'score': 10.71}, {'connected_gene': 'ENSG00000246465', 'score': 0.39}, {'connected_gene': 'ENSG00000283662', 'score': 0.37}, {'connected_gene': 'SBK1', 'score': 0.37}]
chr16 GH16I029258 29258969 29270285 1.65 [{'connected_gene': 'ENSG00000260953', 'score': 568.02}, {'connected_gene': 'SPNS1', 'score': 23.83}, {'connected_gene': 'ATXN2L', 'score': 21.94}, {'connected_gene': 'NPIPB9', 'score': 18.7}, {'connected_gene': 'ENSG00000260853', 'score': 18.68}, {'connected_gene': 'ENSG00000260367', 'score': 18.59}, {'connected_gene': 'NPIPB10P', 'score': 16.43}, {'connected_gene': 'SMG1P2', 'score': 15.61}, {'connected_gene': 'NFATC2IP', 'score': 14.66}, {'connected_gene': 'NPIPB8', 'score': 13.99}, {'connected_gene': 'INO80E', 'score': 12.73}, {'connected_gene': 'RPS15AP33', 'score': 12.36}, {'connected_gene': 'ENSG00000198106', 'score': 11.67}, {'connected_gene': 'ENSG00000261766', 'score': 11.2}, {'connected_gene': 'ENSG00000260114', 'score': 11.05}, {'connected_gene': 'SH2B1', 'score': 11.01}, {'connected_gene': 'CLN3', 'score': 10.8}, {'connected_gene': 'SGF29', 'score': 10.71}, {'connected_gene': 'TAOK2', 'score': 10.27}, {'connected_gene': 'CDIPT', 'score': 9.9}, {'connected_gene': 'NPIPB7', 'score': 9.74}, {'connected_gene': 'RRN3P2', 'score': 5.01}, {'connected_gene': 'LOC101928188', 'score': 4.43}, {'connected_gene': 'ENSG00000277999', 'score': 0.44}, {'connected_gene': 'ENSG00000284685', 'score': 0.13}]
chr16 GH16I028531 28531802 28535509 1.31 [{'connected_gene': 'PIR42560', 'score': 550.77}, {'connected_gene': 'SULT1A2', 'score': 59.53}, {'connected_gene': 'TUFM', 'score': 27.5}, {'connected_gene': 'APOBR', 'score': 13.79}, {'connected_gene': 'SGF29', 'score': 12.1}, {'connected_gene': 'NPIPB7', 'score': 12.1}, {'connected_gene': 'CLN3', 'score': 11.85}, {'connected_gene': 'IL27', 'score': 10.81}, {'connected_gene': 'ENSG00000251417', 'score': 4.34}, {'connected_gene': 'SULT1A1', 'score': 3.37}, {'connected_gene': 'SPNS1', 'score': 2.75}, {'connected_gene': 'EIF3CL', 'score': 2.54}, {'connected_gene': 'EIF3C', 'score': 2.51}, {'connected_gene': 'NUPR1', 'score': 0.44}]
chr16 GH16I028820 28820140 28820289 0.74 [{'connected_gene': 'ENSG00000260796', 'score': 550.77}, {'connected_gene': 'NPIPB12', 'score': 26.19}, {'connected_gene': 'ENSG00000260853', 'score': 25.72}, {'connected_gene': 'ENSG00000198106', 'score': 19.34}, {'connected_gene': 'SPNS1', 'score': 16.68}, {'connected_gene': 'SMG1P2', 'score': 15.52}, {'connected_gene': 'ENSG00000260367', 'score': 15.49}, {'connected_gene': 'NFATC2IP', 'score': 13.64}, {'connected_gene': 'CLN3', 'score': 12.76}, {'connected_gene': 'ATXN2L', 'score': 11.45}, {'connected_gene': 'RRN3P2', 'score': 11.42}, {'connected_gene': 'NPIPB11', 'score': 9.79}, {'connected_gene': 'RPS15AP33', 'score': 0.44}, {'connected_gene': 'GC16M028787', 'score': 0.21}]
chr16 GH16I029273 29273600 29274200 1.63 [{'connected_gene': 'ENSG00000277999', 'score': 550.77}, {'connected_gene': 'ENSG00000260853', 'score': 64.85}, {'connected_gene': 'NPIPB12', 'score': 59.33}, {'connected_gene': 'ATXN2L', 'score': 54.92}, {'connected_gene': 'INO80E', 'score': 54.75}, {'connected_gene': 'SPNS1', 'score': 53.2}, {'connected_gene': 'NFATC2IP', 'score': 50.03}, {'connected_gene': 'NPIPB13', 'score': 44.46}, {'connected_gene': 'ENSG00000260367', 'score': 35.32}, {'connected_gene': 'SMG1P2', 'score': 34.98}, {'connected_gene': 'ENSG00000261766', 'score': 33.21}, {'connected_gene': 'ENSG00000260796', 'score': 29.34}, {'connected_gene': 'ENSG00000198106', 'score': 27.76}, {'connected_gene': 'CDIPT', 'score': 23.26}, {'connected_gene': 'SGF29', 'score': 21.11}, {'connected_gene': 'PPP4C', 'score': 20.63}, {'connected_gene': 'SLX1A', 'score': 19.31}, {'connected_gene': 'ENSG00000260953', 'score': 13.56}, {'connected_gene': 'CLN3', 'score': 12.49}, {'connected_gene': 'MVP', 'score': 12.26}, {'connected_gene': 'RPS15AP33', 'score': 12.06}, {'connected_gene': 'NPIPB10P', 'score': 10.33}, {'connected_gene': 'NPIPB11', 'score': 9.87}, {'connected_gene': 'ENSG00000238045', 'score': 9.84}, {'connected_gene': 'GDPD3', 'score': 9.84}, {'connected_gene': 'SH2B1', 'score': 9.81}, {'connected_gene': 'SNX29P2', 'score': 4.71}, {'connected_gene': 'ENSG00000284685', 'score': 0.12}]
chr16 GH16I028481 28481996 28482816 0.2 [{'connected_gene': 'ENSG00000261832', 'score': 0.44}, {'connected_gene': 'NPIPB7', 'score': 0.39}, {'connected_gene': 'CLN3', 'score': 0.39}]
chr16 GH16I028486 28486237 28486717 0.2 [{'connected_gene': 'ENSG00000261832', 'score': 0.44}, {'connected_gene': 'CLN3', 'score': 0.44}, {'connected_gene': 'NPIPB7', 'score': 0.37}]
chr16 GH16I028488 28488760 28488889 0.56 [{'connected_gene': 'ENSG00000261832', 'score': 0.77}, {'connected_gene': 'CLN3', 'score': 0.44}, {'connected_gene': 'NPIPB7', 'score': 0.37}]

© 2018 bmi.sjtu.edu.cn. All rights reserved.
浙ICP备18030141号.